玉米野生种基因组研究进展及应用

news/2024/10/4 13:28:57

近日,《生物技术通报》特邀浙江大学农业与生物技术学院陈露研究员(原严建兵老师学生)团队发表综述《玉米野生种基因组研究进展及应用》。本文主要综述了大刍草的基因组进化、数量遗传学、群体遗传学等方面的研究进展,同时对大刍草在未来玉米遗传育种中的应用进行了展望。

玉米的野生近缘种,被统称为大刍草(teosinte)。大刍草主要包括5 个种,7 个亚分类群,这7 种大刍草和栽培玉米一起,构成了玉蜀黍属(Zea genus)。据报道,目前仅有多年生大刍草perennis 是四倍体,其他的大刍草和栽培玉米都是二倍体,拥有10 对染色体。

玉蜀黍属的演化历史

  • 以Mangelsdorf 为代表的杂交起源和以Beadle 为代表的单组起源
  • 现代玉米单一起源于parviglumis
  • 玉米在没有被完全驯化之前,半驯化的本地种就已经引入了北美洲各地,再经亚马逊西南部的二次改良之后,逐渐扩散到南美洲。在这个扩散的过程中,栽培玉米与mexicana 发生着持续的基因渗透,二者可能在距今6 000 年前发生了一次杂交事件,进一步丰富了玉米的遗传多样性,促进了玉米向其他地域的传播。
  • 抗涝大刍草luxurians 最早分化出来,随后才是多年生大刍草的分化。此外,对不同大刍草分化时间的推断显示,luxurians 和perennis 的分化时间非常近。

大刍草在玉米遗传学上的应用

展望

栽培玉米狭窄的遗传基础是制约高产、抗性玉米新品种选育的重要因素。大刍草可以作为重要的遗传资源,使得育种家能通过引入近缘物种的等位基因来改良现代玉米。

然而,当前对大刍草遗传多样性的挖掘,主要集中在玉米直系祖先parviglumis 及其姐妹种mexicana 上的几个有限单株上,对大刍草全部遗传多样性的利用还非常滞后。大刍草的其他特性也认识不足,如iploperennis 具有超强的体细胞再生能力,luxurians 可以作为良好的青贮饲料。更重要的是,进一步的野外考察又报道了一些新的、形态和分布上与上述7 个大刍草具有显著差异的物种。这些物种的群体非常小,并且栖息地还受到人类活动的威胁。

伴随着越来越多大刍草基因组的发表,基因功能验证方法飞速发展,大刍草转基因平台的建立,大刍草中有利位点的快速发掘将更为简单。野生种质资源的解析,驯化前优异等位基因的发掘与利用,将加速适应性玉米新品种的培育进程。

作者简介:陈露,博士。浙江大学“新百人计划”研究员,博士生导师。现工作于浙江大学农业与生物技术学院,作物科学研究所。课题组主要从组学大数据出发,探索作物驯化与适应性演化的遗传机制。近年来在《Science》、《Nature Genetics》、《Molecular Plant》等国际知名期刊上发表研究论文12篇。

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.ryyt.cn/news/44258.html

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系我们进行投诉反馈,一经查实,立即删除!

相关文章

汉字是如何编码的

本文我们简单聊聊汉字编码方案,例如 GB2312。本文我们简单聊聊汉字编码方案,例如 GB2312。 ‍ GB2312 的字符集 字符编码,是对字符进行的编码,那么首先得有一个字符集,然后再去编码,就像 ASCII 码也是对 ASCII 字符集进行的编码。 那中国的字符集怎么设定呢?以 GB2312 为…

exe加壳

New Project:新建项目, Open Project:打开已有项目 Save Project:保存项目 Protect:发布项目,会生成加壳以后的exe 本文来自博客园,作者:小康0,转载请注明原文链接:https://www.cnblogs.com/z13753176959/p/18250272

JGG | 严建兵团队综述生物大数据驱动作物智能设计育种

近期,华中农大严建兵团队在Journal of Genetics and Genomics上发表综述:Engineering the future cereal crops with big biological data: towards an intelligence-driven breeding by design。该文回顾了近年来在作物育种领域取得的进展,涵盖了作物农艺性状的机制、新兴技…

FDRS | 一个开源的智慧农场中继系统

分享一个智慧农业开源项目:农场数据中继系统(Farm Data Relay System, FDRS)。这是一个利用现代信息技术,如物联网(IoT)、大数据和云计算等,为农业生产提供数据支持和管理优化的系统。该系统的核心功能是收集、处理和分析农场相关数据,帮助农民更精准地进行作物种植和管…

farmOS | 一个免费开源的智慧农场管理系统

farmOS简介 farmOS 是一个基于 Web 的应用程序,用于服务器场管理、规划和记录保存。它由农民、开发人员、研究人员和组织组成的社区开发,旨在为农业数据收集和管理提供标准平台。 farmOS服务器建立在Drupal之上,这使得它模块化、可扩展和安全。farmOS Field Kit 应用程序通过…

尘封在文件夹中的GWAS和QTL定位的古老笔记

long long ago,小野记录了关于重测序基因定位和GWAS相关的笔记。打开古老的文件夹,发现有些东西依然不过时,零零散散,随意发布。QTL定位策略:群体类型:作图群体,自然群体 选材策略:全群个体分析,选择基因型分析,混合分组分析 优点:适合稀有基因研究;群体可控,目的…

拜耳推出农业生成式AI系统GenAI

近期,拜耳公布了一项开创性的试点计划,引入了一个专业的生成式人工智能(GenAI)系统,旨在提高效率,并增强农艺师的日常工作能力。利用专有的农艺数据,拜耳利用其全球农艺师网络数百年的丰富经验,训练了一个复杂的大型语言模型(LLM)。GenAI系统代表了农业技术的重大飞跃…

泛基因组比对教程

通过代码指导 Minimmap2 基因组比对和 seq-seq-pan 泛基因组比对,并在 R 中进行可视化。本教程提供了一个示例,该示例使用Heliconius butterflies中optix基因位点的两种单倍型。 教程: https://stevenvb12.github.io/代码: https://github.com/StevenVB12/Tutorial_pan_gen…